Tripos.SYBYL-X.ORCHESTRAR.Databases.v0808.231-SPYRAL

Section

Appz

Group

SPYRAL

Size

600,27 MB

Files

14

Date

2010-11-13

NFO

                             ░
    ▀                                          ▌              ▌      ▒
                ▌            ░                                       ▓
    ▄▄▄▄▄▄          ▄        ▓          ▀                        ░ ▒▓█▓▒ ░
   ▐▒▒▒░░ ▌              ░ ░▓█▓░ ░                 ▄     ▄▄          ▓
  ▐▓▒▒▒░░░ ▌                 ▓               ▄▄▄▄▄▀▒▀▄ ▄▀▒▒▀▄        ▒
 ▐▓▓▒▒░░░░░ ▌                ░             ▄▀▒████  ▒▒▀▄▒  ▒▒█
 ▐▓▓▒▒░░░░░ ▌       ░                    ▄▀▒▒   ████  ▒░█   ▒░█      ░
  ▐▓▒▒▒░░░ ▌              ▀  ░           ▒       ▓███  ░░███ ░█ ▄         █
   ▐▒▒▒░░ ▌         ░               ▄▄████████     ░██  ░░███░██▒▀▄
     ▀▀▀▀▀          ▓             ▄▀▒  ▒██████████  ░██  ░███░░█ ▒░█▄▄
                    █           ▄▀▒▒ ▄██▄ ░▓▓▓▓█████ ░██ ░░██ ░█  ░█▒▀▄
          ▌    ░ ░▓█ █▓░ ░      ▒▒ ▄▀▒▒▒▒▀▄▄ ░▓▓▓▓▓██ ▓█  ░██░░█ ░██▒▄▀    ▀
                    █            ▄▀▒ ▒ ▓▓▒▄▄▄  ░░░▓█   █  ▓██ ██ ░██▒█
                    ▓          ▄▀ █████████▓▓████      ▓  ▓████  ██▒▒█   ▀▄
   ▄       ▀        ░         ▄▒ █▒▒▒▒▒▒▒▒█████▓██        ▓████ ░██▒██   ▒▄▀
                          ▌  ▄▒ █▒        ███ ██            █  ███▒▒██  ▒▄▀
    ▀     ▄         ░        ▒ █▒    █████ ░▌▐                ███▒███ ▒▒█ 
                              █▒   ▓█    ███▐██              █▓▓▓██ ░░██  ▀▄
               ▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄ ▄██   ███ ██▓▓             ▓▓████░░██ ▒▒▒▀
            ▄░░░▒▒▒▓▓█████████▓▓▓▓█ ▄ ███▌ ██ ▓█          ▓ ████░░░░██ ▒▄▄▀
  █       ▄  ░░▒▒▓▓▓███████████████   █ █ ██  ██     ██▀▄ ███████████ ▒█░ ▀▄
         ▌   ░░█████████████████████████▓ █ █ █▓███ █▓▌█ ▀▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄█   ▄▀
          ████████████████████████████████ ████▓██▓ ██▓███▓             ▄▀ 
       ▌ ▓██████████████████████████████████▒█▓▓██▓▓ █▓  ████░░░░░░░█▀▀▀
      ▌   ██████████████████████████▓▓▓█████ ▓▓▓███▓░ ██▓▓ ██▀▀▀▀▀▀▀   ▒▒
     ▌    ░░░████████████████████████▓▓▒▒░████  ███▓░ █ █▓▓          ▒▒▄▀
    ▌   ░░   ░▒▒▒▒██████████████████████▒▒░ ░██▓ ░██░░ ████▓▓▓░░░░░░▒▄▀      ▀
   ▐ ▒████░▒▒▒▒▓▓▓▓▓██████████████▒▒██████░░░██░▐ ███░░░░ ████████▄▒▀
  ▐   █████████████████████████████▒▒░░████    ░░▐ █████░░▒▒▒▒▒░▒▄▄▀
 ▐     ░███████████████████████████▓▒▒░░ ████░  ░ ▐░░░█████████▄▀
 ▌    ░░▒▒▒█████████████████████████▓▒▒░░░████       ▀▄
 ▌  ░░░░▒▒░▒██████████████████████▒█▓▒▒  ░░██████   █  ▀▄                ▌
 ██ ░░▒▒░ ▒█████████████████████████▓▒▒░  ░░░████  ▓█    ▀▀
 ████░ ▓▓█████████████████████████████▒▒░  ░░░█████▓▐               ▀
 ▌█████████████████████████████████████░░░   ░  ██▓▓ ░      ▌    ░
 ▌  █████████████████████████████████████            ▐
 ▌▒▒▒▒█████████████████████████████████████                ▀     ░       ▀
 ▌▒▓▓▒░░░████████████▓▓████████████████████████▓▒    ▐           ▓
 ▌██▓▓▒▒░░  ██████████▓▒██████████████████████████ ▓▓            ▀
 ▌▌███▓▒▒░░░  ████████▓▒██████████████████▓███████▓▓▓▐      ░ ░▓▌█▐▓░ ░
 ▌   ██████░     █████▓▒▒▒███████████████████░████               ▄  ░
 ▌    ███████░░░   █░██▓▓ ▒ █████████████████████   ▐            ▓  ░
 ▌░░    ████████░     ████▒▒  ████████████▓░██▓▓▓▓▓      ▀       ░
  ▌░░     ███████░░░    █████      ██████████   ▓▓▓▐    ░           ░
   ▌░░     ████████░░      █████      ▓███████░                  ░  ▒▀     █
    ▌░░   ███████████░░░        █████       ███▓▓▐      ▓           ▓
     ▄░░░    ██████████░░░░░░░       █████████       ░ ▓█▓ ░       ▄▄▄
 ▌    ▄█░░░   ██ █████████████░            █▓▓▓▐        ▓         ▐▓▒▒▌
        ▄█░    ███  █████████████░░                              ▐▓▓▒▒░▌
         ▄▓█▒    ████  █████████▓▓▓▓▓▓░░░░  ▐           ░   ░░ ▒▓▐▓▒▒░░▌▓▒ ░░
      ▀   ▄ ▓██      ████     ░███▓▓▓░    ▐                      ▐▓▒░░ ▌
     ▄       ▄▄▒██▒     ███████    ███▐▄            ▌             ▐▓░ ▌
               ▄▄▄▄██▒░        █    ▄          █                   ▀▀▀
                    ▄ ▄▄ ▄ ▄  ▄ ▄                                   ▓
   ▌        ▄                                                       ▒
                                                             ▌
   ▄                                       ▄    ▌                   ░
                       ▌        ▌                        ▄          ░
            ▌
 ▄       ▄      ▄              ▌
                                      ▓█                                   ▄
  ▓███████ ▓███        ▓████    █████ ▓███████████      ▓████    ▓██████
 ▓███ ▄ ███ ▓███████████▓████      ██   ▓████  ████     ▓█████ ▌ ▓▓████
▓████▓█████  ▓████    ██▓███     ▌ ██  ▓██    ▄ ███  ▄ ▓██  ▓█    ▓████
▓████     ▄  ▓██   ▌   █▓███  ▄    ██ ▓████     ███    ▓█   ▓██   ▓████
 ▓███████    ▓███   ████▓███      ███ ▓███████████     ▓██ ▓███   ▓████
   ▄▄▄ █████ ▓█████████ ▓████████████ ▓███  ███        ▓████████  ▓███ ▓█████
 ▓████ ▓████ ▓███ ████    ▓████████   ▓███  ███▐████  ▓██   ▓███   ▓██ ▓█████
▓█████ ▓████ ▓███            ▓███     ▓███  ███▐████▓▓▓█    ▓███   ▓███ ▓██ █
▓████  ▓███  ▓████          ▓█████    ▓████ ███ ████▓███    ▓████  ▓███    ██
 ▓██   ▓███  ▓████   ▄    ▓█████████ ▓█████  ███ ██ ▓█████  ▓█████▓█████████
  ▓██████   ▓█████                            ████
       ▄            ▌          ▌                            ▌      ▄      ▄
                        ▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄
█  ░░▒▓▌ ░░░░░▒▒▒▒▒▓▓▓▓▓        THE SPYRAL GALAXY       ▓▓▓▓▓▒▒▒▒▒░░░░░ ▐▓▒░░  █
█ ░░▒▓▌▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▐▓▒░░ █
█░░▒▓▌                                                                    ▐▓▒░░█
█░▒▓▌                         [ PROUDLY  PRESENTS ]                        ▐▓▒░█
█▒▓▌                                                                        ▐▓▒█
█▓▌                                                                          ▐▓█
█▓▌                                                                          ▐▓█
█▒▌             █████████████████████████████████████████████████            ▐▒█
█▒▌        ▄▄▄▄░▓ ▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄ ░▓█▐▌█▓░ ▄▓░▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄▄▄▄        ▐▒█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▒▒▌▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓█▒▒█▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▐▒▒▒▐█▒▒░░░  ▐░█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▀▀  ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀▒▐█▒▒░░░  ▐░█
▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▌▒▌                                                    ▐▒▐▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄
█▓▓▓▒▒▒▒░░█▌▒▌      SYBYL-X ORCHESTRAR Databases v0808.231        ▐▒▐█░░▒▒▒▒▓▓▓█
█▒▒▒▒░░░▒▒█▌▒▌                    (c) Tripos                      ▐▒▐█▒▒░░░▒▒▒▒█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▄▄                                                  ▄▄▒▐█▒▒░░░  ▐░█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▒▒▌                                                ▐▒▒▒▐█▒▒░░░  ▐░█
█░▌        ▀▀▀▀                                                  ▀▀▀▀        ▐░█
█░▌                                                                          ▐░█
█░▌                           Type ..... : Molecular Modeling                ▐░█
█░▌                           Date ..... : 11/2010                           ▐░█
█░▌                           Size ..... : 74x50MB                           ▐░█
█░▌                           OS ....... : Windows/Linux                     ▐░█
█░▌                                                                          ▐░█
█░▌                                                                          ▐░█
█░▌                                                                          ▐░█
█░▌             █████████████████████████████████████████████████            ▐░█
█░▌        ▄▄▄▄░▓ ▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄ ░▓█▐▌█▓░ ▄▓░▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄▄▄▄        ▐░█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▒▒▌▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓█▒▒█▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▐▒▒▒▐█▒▒░░░  ▐░█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▀▀  ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀▒▐█▒▒░░░  ▐░█
▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▌▒▌                                                    ▐▒▐▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄
█▓▓▓▒▒▒▒░░█▌▒▌                                                    ▐▒▐█░░▒▒▒▒▓▓▓█
█▒▒▒▒░░░▒▒█▌▒▌                                                    ▐▒▐█▒▒░░░░▒▒▒█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▄▄──────────────────────────────────────────────────▄▄▒▐█▒▒░░░░ ▐░█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▒▒████████████▓░  [ RELEASE  NOTES ]  ░▓████████████▒▒▒▐█▒▒░░░░ ▐░█
█░▌        ▀▀▀▀──────────────────────────────────────────────────▀▀▀▀        ▐░█
█░▌                                                                          ▐░█

     Optional Databases for Advanced Protein Modeling
     Tripos supplies several databases for use with FUGUET and ORCHESTRAR.
     
     Enhanced protein modeling capabilities

     * Support for new, remediated PDB format from the RCSB.
     * Build terminal loops within Advanced Protein Modeling's ORCHESTRAR
       technology allowing a complete model to be created. Also manage
       cofactors, ligands, waters and metals with the ORCHESTRAR technology.

█░▌                                                                          ▐░█
█░▌             █████████████████████████████████████████████████            ▐░█
█░▌        ▄▄▄▄░▓ ▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄ ░▓█▐▌█▓░ ▄▓░▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄ ▓▄▄▄▄        ▐░█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▒▒▌▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓▄░▓█▒▒█▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▄▓░▐▒▒▒▐█▒▒░░░  ▐░█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▀▀  ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀ ▀▀▒▐█▒▒░░░  ▐░█
▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▌▒▌                                                    ▐▒▐▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄▄
█▓▓▓▒▒▒▒░░█▌▒▌                                                    ▐▒▐█░░▒▒▒▒▓▓▓█
█▒▒▒▒░░░▒▒█▌▒▌                                                    ▐▒▐█▒▒░░░░▒▒▒█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▄▄──────────────────────────────────────────────────▄▄▒▐█▒▒░░░░ ▐░█
█░▌  ░░░▒▒█▌▒▒▒████████████▓░  [  INSTALLATION  ]  ░▓████████████▒▒▒▐█▒▒░░░░ ▐░█
█░▌        ▀▀▀▀──────────────────────────────────────────────────▀▀▀▀        ▐░█
█░▌                                                                          ▐░█
█░▌  Unrar, burn/mount, install. SYBYL-X must be pre-installed.              ▐░█
     
     Expect this installation to take 1-3 hours.

     If your existing advanced protein modeling databases are in the
     orchestrar_db folder parallel to your SYBYL-X installation,
     SYBYL-X is automatically configured to use them.

     If your existing advanced protein modeling databases are not in the
     orchestrar_db folder parallel to your SYBYL-X installation, you
     must configure SYBYL-X. To do so use a text editor, such as
     Notepad++. Do not use WordPad or Notepad distributed with Windows.

     A. In your SYBYL-X installation open the folder containing the
     files that must be modified.
     If you installed SYBYL in the default location this will be:
     C:\tripos\sybylx1.2\lib

     B. Near the top of the ta_site.sh and ta_site.csh files insert the
     following line after the first commented lines, replacing"<...>" with
     the path to the folder containing your existing advanced protein
     modeling databases.
        in ta_site.sh
         export TA_ORCHESTRAR_DB=<...>
        in ta_site.csh
         setenv TA_ORCHESTRAR_DB <...>
█░▌                                                                          ▐░█
█░▌                                                                          ▐░█
█░────────────────────────────────────────────────────────────────────────────░█
█░░░▓████████████▓░    [ Locked in a gravitational spin ]   ░▓████████████▓░░░▒█
█▒────────────────────────────────────────────────────────────────────────────▒█
█▒▌             ███████████████████▌▌▌▌▌▌▌▌▌███████████████████              ▐▒█
█▓▌             ▐▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▌█████████▐▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▓▌              ▐▓█
█▓▌            ▐▓▓░ ░▒▓▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀██▓▓▒░█░▒▓▓██▀▀▀▀▀▀▀▀▀▀▓▒░ ░▓▓▌             ▐▓█
█▒▓▌          ▐▓▓░ ░▒▓▀█ █ █ █ █▌▒▒▒▒▒▐▓▐▒▒▒▒▒▐█ █ █ █ █▀▓▒░ ░▓▓▌           ▐▓▒█
█░▒▓▌        ▐▓▓░ ░▒▓▀░░░░░░░░░▌▒▒▒▒▒▐▓▓▓▐▒▒▒▒▒▐░░░░░░░░░▀▓▒░ ░▓▓▌         ▐▓▒░█
█░░▒▓▌      ▐▓▓░ ░▒▓▀█████████▌▓▓▓▓▓▐▒▒▒▒▒▐▓▓▓▓▓▐█████████▀▓▒░ ░▓▓▌       ▐▓▒░░█
█ ░░▒▓▌    ▐▓▓░ ░▒▓▀▓▓▓▓▓▓▓▓▓▌▓▓▓▓▓▐▒▒▒▒▒▒▒▐▓▓▓▓▓▐▓▓▓▓▓▓▓▓▓▀▓▒░ ░▓▓▌     ▐▓▒░░ █
█  ░░▒▓▌  ▐▓▓░ ░▒▓▀░░░░░░░░░▌█████▐░░░░░░░░░ █████▐░░░░░░░░░▀▓▒░ ░▓▓▌   ▐▓▒░░  █
█████████████████▓▓▓▓▒▒▒▒░░░░ ascii by: PushX2WiN ░░░░▒▒▒▒▓▓▓▓██████████████████
████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████
████████████████████████████████████████████████████████████████████████████████

Files